よく使う方法です。サービスを止めてはいけない状況で、apacheを再起動する方法です。この方法であれば、サービスは停止しません。OSはCentOS6.5です。
/etc/init.d/httpd graceful
これは何をしているかというと、アクセスが全部終わったhttpdプロセスから順番に再起動をしてくれるというものです。ただし、httpd.confの設定が間違っていたりすると、徐々にhttpdが死んでいって1分後にアクセス不能。とかそういうことがあります。
ですので、以下のコマンドで書式が間違っていないか、graceful実行前に確認してください。書式に間違いがあると指摘してくれます。
apachectl configtest
覚えておくと便利だと思います。