チェックボックスのなかで、チェックされているフォームの値だけを、jQueryを使って取得する方法です。
以下の様なHTMLを用意します。
<label for="test1" class="checkbox">
<input type="checkbox" name="data[hogehoge][]" value="checked1" id="test1"> checkbox1
</label>
<label for="test2" class="checkbox">
<input type="checkbox" name="data[hogehoge][]" value="checked2" id="test1"> checkbox2
</label>
<label for="test3" class="checkbox">
<input type="checkbox" name="data[hogehoge][]" value="checked3" id="test3"> checkbox3
</label>
スクリプトは以下のように記述します。もし、checkbox1にチェックが入っているときは、valueにchecked1が入ります。複数チェックが入っているときは、チェックされている数だけループが発生します。
$('.checkbox input:checked').map(function() {
value = $(this).val();
console.log(value);
});
ループのなかでそれぞれ処理するようにしてください。